旋風吸塵器具有結構簡單、造價低、體積小等優點，并且吸塵效率比重力沉降室和慣性吸塵器高，且無運動部件，運行管理非常簡便，因此它的應用范圍非常廣泛。
 
旋風吸塵器一般只適用于凈化非纖維、非黏結性粉塵，以及溫度在400℃以下的非腐蝕性氣體。用于處理腐蝕性氣體時，吸塵器應采用防腐鋼板制作或內壁噴涂防腐材料；用于處理高溫氣體時，則需采取冷卻措施，并應選擇耐磨性能好的材料。

旋風吸塵器入口風速一般為12～20 m/s，當流量不穩定時，對吸塵效率和壓力損失影響較大。由于氣溫與體積流量有關，因此不宜用于氣溫波動很大的場合。同時，應采用氣密性好的卸塵裝置或其他防止底部漏氣的措施。

另外，旋風吸塵器一般不宜串聯使用。若并聯使用時，應盡可能使每臺吸塵器的處理氣量分布均勻，以免吸塵器之間產生串流，降低總效率。